Η λειτουργία του Προγράμματος Μεταπτυχιακών Σπουδών διέπεται από:

-την απόφαση ίδρυσης του Π.Μ.Σ.,

-τον Εσωτερικό Κανονισμό Λειτουργίας του,

-την κείμενη νομοθεσία.